教育部於 2026 年 3 月 30 日嚴正指出，針對國立台灣大學住宿輔導員涉入的校園性別事件，校方未能依司法判決補正程序並重啟調查，已於 2026 年 3 月 26 日召開性平會，決議要求台大立即啟動重新調查。這項決議視同校內性平會決議，台大必須配合辦理，否則教育部將依相關規定追究其責任，並將違失納入學校評鑑。
教育部要求重啟調查：程序瑕疵與延宕
這起爭議源於教育部在 2025 年 8 月 19 日的性平會決議，當時已要求台大停止該名住宿輔導員的職務，並禁止其與當事學生接觸，同時追蹤後續行政訴訟與刑事案件的結果。然而，在台北高等行政法院於 2025 年 10 月 16 日判決撤銷原處分後，教育部便發函要求台大依法處理並評估是否重啟調查。但台大校方卻回覆，將等待最高行政法院與刑事判決確定後再行辦理，此舉引發教育部對程序延宕的擔憂。
為了避免調查程序持續延宕，教育部在 2025 年 12 月 23 日再次要求台大依《性別平等教育法》（簡稱性平法）召開性平會，審議此案的程序瑕疵以及是否應重啟調查。然而，直至 2026 年 3 月，教育部仍未見台大有具體進展，因此最終做出此項強硬要求，命令校方立即重啟性平調查，以確保學生權益不受損害。
各方立場與學生權益呼籲
對於台大處理此案的態度，台大學生會於 2026 年 3 月 30 日赴立法院召開記者會，公開指出校方在處理過程中缺乏即時性與透明度，未能有效回應學生對於校園安全的疑慮。學生會呼籲教育部應強化對大學性平事件的監督機制，確保校園環境的安全與公正。
同時，其他學生團體也強調，校園性平事件的核心原則應是優先保護學生，不應讓程序上的問題成為延誤調查或損害學生權益的理由。他們認為，程序正義固然重要，但學生的身心安全與受教權益才是最應被重視的。
面對各界質疑，台大校方發布聲明表示，校方尊重司法判決，儘管並非訴訟當事人，因此無法完全掌握判決全文，但在獲悉判決結果後已立即召開會議研議，並已做出相關決議。台大強調，為保障學生權益並符合法規，該名涉案的住宿輔導員將不再任職於學校。
後續觀察與教育部監督機制
教育部嚴正強調，若台大後續未能依循規定辦理，將依據《性平法》相關條文，把台大的違失行為納入學校評鑑項目，並可能扣減對學校的補助款項，同時追究相關人員的責任。教育部表示，將持續督導台大依法處理此案，以確保校園性別平等的落實與學生安全的維護。